发简信
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全转录组
什么是全转录组？ 全转录组是指细胞所能转录出来的所有类型RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）。目...
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定量蛋白质技术策略定量蛋白质组学主要有两种策略： 标记定量（Label）非标记的定量（Label Free） 标记定量： 体内标记（如 SILAC）体外标记（如 ...
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RNA-seq数据矫正-样本内标准化RNA-seq是通过NGS技术来检测基因表达量；但是由于不同基因的长度不同，不同批次数据的测序量不同，原始的count值（raw count）不...
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转录组对基因表达量进行计数(Htseq、featureCounts）对基因进行定量，首先需要计算出比对到各个基因的read counts，得到没有校正的表达矩阵。在基因层面的count计数的工具：Htseq-co...
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有参转录组比对到参考基因组一、下载参考基因组和参考基因注释文件构建 可以从UCSC、Ensembl、NCBI下载，但是要注意参考基因组与注释文件得配套。 1、Ensemb...
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ubuntu的python环境配置比如tophat2在python3的环境下就会有如下错误 在python2的环境下就能正常运行
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使用cutadapt去除接头引物在对数据质控的时候发现reads有接头数据，所以要对其就行去除。 官网 https://cutadapt.readthedocs.io/en/s...
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使用fastqc进行质控
高通量序列数据的质量控制工具FastQC旨在提供一种简单的方法，对来自高通量测序管道的原始序列数据进行一些质量控制检查。它提供了一组模块化的分析...
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差异表达基因Venn韦恩图文献复现1、为什么要画韦恩图？ 在对两个或多个样品之间基因集合比较，查看多少基因是几个样品共有，多少基因是几个样品特有，基因之间的交集是怎样的，我们会采...