在生物学分析中，我们经常会针对某个基因进行生物学功能分析，比较常见的包括基因结构预测，功能注释，蛋白质结构域预测（跨膜域，信号肽），同源基因分析，多序列比对，亚细胞定位预测，...
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单个基因的生物信息学分析(1)-基因结构与功能分析 -
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查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点
基础知识 首先我们了解一些基础知识（注：文中图片皆可点击放大查看！）： 启动子（promoter）：与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。转录起始点（TSS）：转录时...
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实用 | 优雅地提取部分基因结构注释信息写在前面 很久很久以前，我就已经写过 GFF3/GTF 注释信息的部分提取功能。每一个GXF文件，往往包含的两万个左右基因（数万个转录本）的外显子，CDS等信息。而我们一般感...
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【陪你学·生信】六、当你有一段待分析的氨基酸序列
这一推送将简单介绍： 1.寻找蛋白质结构域 2.简单预测序列的理化性质 4. 预测蛋白酶降解位点 5.预测卷曲螺旋区域（coiled-coil domains） 6. 预测翻...
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学习笔记-如何阅读质粒图谱
最近因为新冠肺，迟迟不能上班，在家闲着想着也要学习，就查找了和工作相关的-学些构建质粒，那么首先需要学习如何看质粒图，下面是这两天学习到的，总结的记录一下： 1. 复制起始位...
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PSORT--蛋白质亚细胞定位预测1、分析蛋白质的亚细胞定位有助于了解：蛋白质功能和蛋白质互作生物体细胞器类型：细胞核蛋白质、线粒体蛋白质、内质网蛋白质、细胞膜、叶绿体蛋白质、高尔基体2、通过生物信息学在线分...
