燕麦（Avena sativa）作为谷物中最好的全价营养食品，因其富含蛋白质、不饱和脂肪酸以及可溶性膳食纤维而广受消费者青睐。同时，栽培燕麦是六倍体作物，它在生物量、活力和对...
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基因组文章 | 2022《Nature Genetics 》六倍体栽培燕麦的起源与进化 -
2018-09-22 WES文献阅读3wes文献抄读3 Title：Whole-exome sequencing reveals the origin and evolution of hepato-cholan...
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全长转录本结构分析（下）
作者：Arno审稿：童蒙编辑：angelica 前面我们介绍了PacBio三代全长转录组测序相关的全长转录本鉴定、全长转录本比对、全长转录本结构分析上篇。 今天我们继续介绍包...
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miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】该教程分为2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】 因为之前碰到...
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点点滴滴的琐碎/迭代更新着意识
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(效率人生)程序员必备工具Dash作为一名程序员，每天最常见的动作就是查看各种API文档，你一定也有过同时打开N个窗口（HTML、PDF、CHM），不停的在编辑器与文档之间切换。不仅消耗时间，而且效率也低。各...
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非常实用的 Python 库，推一次火一次！推荐：Python全栈教程！花了29980买的从入门到精通课程，分享给大家[https://www.bilibili.com/video/BV1YZ4y197RY] Pyth...
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生信6--SAM和blasttab+过滤一样的结果
我在处理数据的时候发现sam文件和blasttab+文件排序不同sam文件是按照reference里面的名字排序的，而blasttab+是从高到低排序的 因为我发现在过滤转化...
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生信5--python多线程multiprocessing模块
用multiprocessing模块来多线程from multiprocessing import Process 先用列表建立一堆Process对象run_SNP_modu...
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生信4--用python将blasttab+格式文件和fasta文件写成class对象并给予方法
blasttab+结果写成class先每一行解析一下 发现不是很方便，那就把每一行形成一个列表写成类对象，用了pandas模块方便一点 这样，运行下面代码 然后把结果解析成L...
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生信3--使用python搭建生信流程之python交互式运行本地化blastn
最近正好用python重新搭建流程，就展示一下python和Linux系统的互动os是operating system（操作系统）的缩写，所以Python的os模块封装了常见...
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生信2--利用Biopython解析genebank格式文件Ncbi下载的文件很多是注释完的Genebank格式文件，如果只有一个菌株的全基因组注释还能人工通过查删改，如果是一个文件含有大量的菌株，就要自动化解析了。 如果只有一条记录...
