1.SPAdes的使用目的 当前版本的SPAdes与Illumina或IonTorrent读取一起使用,并且能够使用PacBio,Oxford Nanopore和Sanger...
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写在“写在前面”的前面 既然你说我是标题党,那我就证明给你看,我就是个标题党,是或不是,我说了算 写在前面 《-零命令行-生信下游数据分析》的第三帖主题,定为ORF预测。可能...
1. 软件简介 CFVisual_V2.1软件是一款借助Python语言的matplotlib库和PySide2库进行生物序列结构绘图的数据可视化软件,主要用于生物信...
写在前面 有些事情,说要做,就总要做的。Emmm,过去的几年,开展高通量测序数据分析时,常常遇到的两个问题,已经有了一定的改变: 本机硬件性能不行,现在基本都还行,主频或睿频...
本节概览:1.在文章中找到 GEO accession number, 从NCBI获取数据SRR号2.在linux中使用prefetch命令根据SRR号下载SRA文件3.使用...
前言 康奈尔大学,FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子 (TF)、转录调节因子 (TR) 和蛋白激酶 (PK),...
REACTOME 是一个开源、放开、人工整理并经过同行评审的通路数据库。目标是为各个通路提供可视化、可解释的分析,以支持基础研究、临床研究、基因组分析、建模、系统生物学等。 ...
写在前面 硕士毕业做的大豆内参基因的筛选,当时用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三个软件,geNorm 不需要多说,Vandesompele教授的...