有的 R 包可能要求一个更高版本的 R 才能安装或正常工作，所以先安装或者更新R，来更轻松地安装并使用最新的 R 包。 一、 1. 更新 R 到更高版本 ① 在 Ubuntu...
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怎么升级Linux中的R版本 -
怎么在 Linux 中安装 R 包（如 ape、ggplot2 和 ggtree）
一、 安装 R 基础环境 如果还没有安装 R，请先安装 R 的基础环境。在大多数 Linux 发行版中，可以通过包管理器来安装 R。 ① 对于 Ubuntu/Debian 系...
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全基因组测序（WGS）数据分析：第1节 测序技术第1节 测序技术 全基因组测序的英文是Whole Genome Sequencing，简称WGS，目前默认指的是人类的全基因组测序。 所谓全（Whole），指的就是把物种细胞...
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全基因组测序（WGS）数据分析：第2节 FASTA和FASTQ第2节 FASTA和FASTQ 其实之前有写过，FASTA和FASTQ 的部分内容。在本次就更详细地介绍一下。 首先，FASTA 和 FASTQ 是存储核苷酸序列信息（即 D...
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全基因组测序（WGS）数据分析：第3节 数据质控第3节 数据质控 一、正式流程的搭建，整个完整的流程分为以下6部分： ① 原始测序数据 fastq 的质控 QC； ② read比对，排序和去除重复序列； ③ Indel区域...
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全基因组测序（WGS）数据分析：第4节构建WGS主流程第4节构建WGS主流程 这是WGS数据分析的流程图。流程的目的是准确检测出每个样本（这里特指人）基因组中的变异集合，也就是人与人之间存在差异的那些DNA序列。 一、准备阶段 ...
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