多序列比对(Multiple Sequence Alignment,简称 MSA)大家应该都不陌生了吧!这是用于比较多个序列相似性和差异性的常用分析方法。 在 Linux 系...
多序列比对(Multiple Sequence Alignment,简称 MSA)大家应该都不陌生了吧!这是用于比较多个序列相似性和差异性的常用分析方法。 在 Linux 系...
学习GO富集分析 一、准备 如果想安装动物的数据库可以用OrgDB数据库,其中包含了19个模式物种对应的全基因组注释R包,方便直接根据物种基因ID进行GO,KEGG注释分析等...
跑一遍 一、数据准备和读取 拟南芥数据 二、数据处理 三、可视化 1、气泡图 2、柱形图 今天就不介绍图形了,就跑个完整代码~下次出专门介绍各种图的。 生物信息学领域非常广泛...
一、力导向布局(Force-directed Layout): 力导向布局可以通过模拟物理力(例如斥力和引力)来摆放节点,使得相互作用较强的蛋白质会被拉得更近,反之则相隔更远...
SNP密度图是一种常用的遗传学数据可视化工具,主要用于直观展示单核苷酸多态性(SNP)在基因组上的分布密度。 通过该图,研究者可以有效地分析SNP在不同染色体或基因组区域的分...
一、文献 WGCNA(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,加权基因共表达网络分析)是一种用于挖掘高维基因表达数据的系统生...
这是我看别人数据画的,比一般的火山图好看,那我们用上次的数据试一下。 1、上代码,简单处理一下数据即可绘图 2、出图(代码正常运行,数据自己调整啦~) 3、完毕 生物信息学领...
在生物学和植物学研究中,地图作为展示物种分布、分析生态环境关系以及追踪动态变化的重要工具,具有不可或缺的作用。 通过地图,研究人员能够直观地呈现植物物种的地理分布范围,深入探...
有的 R 包可能要求一个更高版本的 R 才能安装或正常工作,所以先安装或者更新R,来更轻松地安装并使用最新的 R 包。 一、 1. 更新 R 到更高版本 ① 在 Ubuntu...