作者:snail编辑:angelica 引言 跟着阿拉丁一起学习的时间又到了~~ ATAC-seq利用DNA转座酶(Tn5)切割开放的DNA区域并结合二代高通量测序技术来研究...
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作者:snail编辑:angelica 引言 跟着阿拉丁一起学习的时间又到了~~ ATAC-seq利用DNA转座酶(Tn5)切割开放的DNA区域并结合二代高通量测序技术来研究...
http://dalexander.github.io/admixture/admixture-manual.pdf[http://dalexander.github.io/...
在得到我们感兴趣的基因集后,除了对其进行GO等富集分析查看与什么重要的生物学通路相关,还可以进行PPI蛋白互作网络(PPI, Protein-Protein Interact...
1. clusterProfiler包,bitr()转换ID函数 clusterProfiler 是Y叔写的一个功能强大的R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO...
部分代码参考自10x genomics官网[what-is-cell-ranger-atac],但绝大多数代码融入了我自己的思考 1、上游分析(软件安装 + 数据获取 + c...
ATAC-Seq简介 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput seq...
sed文本处理工具的用法: 用法1:前置命令 | sed [选项] '条件指令'用法2:sed [选项] '条件指令' 文件.. .. 相关说: 条件可以是行号或者...
计算各个cluster的细胞数; table(Idents(pbmc)) 定义对应每个cluster对应的细胞类型,也可将ident改为相应的细胞类型,计算每个细胞类型的细胞...