共病遗传（或称异病同根），我们对疾病的认识从回溯至遗传学根源的那一刻起就已经进入了另一个新的里程。 今天我想分享一篇今年9月24日发表于 《Nature communicat...
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共病遗传的研究方法：关于多发性硬化症和炎症性肠炎遗传共病研究的例子 -
表达数量性状位点（eQTL）的概念及其相关分析
表达数量性状位点（expression quantitative trait locus, eQTL）是一类能够影响基因表达量的遗传位点（大部分都是单核苷酸多态性，SNP），...
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2020-05-04 eigenMT
eigenMT：解释变异间连锁不平衡的eQTL研究的有效多重检验调整 简介 特征最小二乘法是顺式eQTL研究中一种计算效率较高的多重检验校正方法。通常，现代顺式eQTL研究可...
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使用OSCA进行eQTL分析Nathan写于20200807。OSCA（OmicS-data-based Complex trait Analysis）是杨老师2019年发表的用于分析多组学数据复杂性状...
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单细胞转录组测序中的降维和聚类前言 在以往常规转录组测序中，由于实验生物学重复，同组内测序得到的数据是接近的，通过简单的线性降维PCA主成分分析法，即可得到想要的可视化结果（组内样本聚集，组间样本分离）。...
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清明节后第一天从画一张图开始今天我们的任务就是复现一张图，如下： 来吧，这个图的复现不见得简单，不信大家可以尝试一下： 首先来学习一下ggrepel包 用法是geom_text(label)_repel...
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单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
