苦旅_e607
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请问：comp1.edgeR <- dba.report(dbObj, method=DBA_EDGER, contrast = 1, th=1)里面的contrast和th是什么意思？谢谢啦
IP属地：乔治亚
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@caokai001 感谢指导！我还是有点疑惑，听您的描述这该是一个左右一一对应的dataframe是吗？然后readtable的时候需要col.name=2吗？
Seurat3 学习笔记
参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
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@caokai001 您好 我私信回不了 需要绑定国内手机号…感谢回复！请问metadata可以通过read.table获取吧？cell name和cell stage信息是左右一一对应还是上下对应呀？😭
Seurat3 学习笔记
参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
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Seurat3 学习笔记参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
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@caokai001 我现在是美国时间凌晨4点😓 苦苦无法找到根据已有的分群信息计算差异基因的办法 才下载了简书看看帖子 我不是做生信的，也是0基础，所以很是艰难。希望您不吝赐教，指点一二！我试了Addmetadata，但是总是报错…虽然知识无价 但是我可以有偿咨询！
Seurat3 学习笔记
参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
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请问：我从GEO上下载了作者已经分好群的表达矩阵（自带annotation信息），可否直接按照分好的细胞群寻找差异基因？该怎么做呢？谢谢！
Seurat3 学习笔记
参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
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Seurat3 学习笔记
参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
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感谢大佬这么细心的帖子！
Seurat3 学习笔记
参考： 1.第六章 scRNA-seq数据分析2.初生牛犊--模仿cell research (IF 17+) 文章的一张图3.Seurat包学习笔记（一）：Guided C...
