范垂钦_92be

一、背景 许多Functional Class Scoring (FCS)方法，如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...

名本无名

前言 TCGAbiolinks 是一个利用 GDC API 接口来查询、下载和分析 TCGA 数据库的数据的 R 包 TCGAbiolinks 包的功能主要可以分为三大块： ...

高大石头

PCA：principal component analysis，主成分分析。将n个维度，通过线性转换为新的n个线性无关的按方差解释度排序的主成分(principal com...

高大石头

疾病亚型预测中常用NTP方法，今天发现一位大神用svm预测亚型，并且在附件中还加入了代码，下面就来围观下吧。 发表杂志：Frontiers in Oncology PMID：...

小洁忘了怎么分身

1.需求 为了直观的展示免疫治疗结果与病人风险高低之间的关系，如图： 2.数据 需要病人的高低风险分组，和免疫治疗结果 3.画图代码 因为数据是编的，就不用看high和low...

QIQIXIE

今天还是因为ROC的问题被审稿人难住了，才意识到自己统计知识的匮乏，事情的经过是这样的，我在文章中加了一个这样的图 然后审稿人就提了这样一个问题In figure 5, th...

白米饭睡不醒

maftools 变异数据处理的总体思路如下： 思维导图 1.数据下载 TCGA的突变数据有4个软件得到的不同版本： 这个可以在gdc的官网上找到，case选择KIRC，文件...