后面的课题与能量代谢有关。而能量代谢又与生命活动息息相关。一想现代人应该很喜欢"控糖减脂"，这个话题，于是就以此来展开。 一、三大物质代谢（糖类、脂类、氨基酸） 糖类代...
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如何快速了解一个课题方向（基因家族）？简单记录一下，一般我是如何快速了解一个课题方向？此处还是以“基因家族”为例。 首先，直接上 CNKI 官方网站，检索基因家族名字，按「被引次数」排序，选择相对权威的期刊，如...
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更好的chatGPT体验~「ai.TBtoos.icu」更新了！傍晚回家吃饭，收到朋友的消息，提及「ai.TBtools.icu」网站更新了，继续给 TBtools 用户朋友提供方便。进入方式，与之前一样。可以通过「Web Awesome...
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TWAS（fusion）最近在看遗传数据与表达结合的东西，介绍一个经典的方法吧，fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches for large-scal...
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不好好作图的NCS系列(五)：从这篇Cell学习GSEA的R语言分析及作图
之前我们在讲转录组系列的时候，说过差异基因的功能富集，用的是GO和KEGG分析。但是这远远不够，很多研究者更喜欢使用GSEA，全名是Gene Set Enrichment A...
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小鼠基因集-GSKB--R进行GSEA富集分析1. 数据集介绍 由于人类基因集富集分析，有msigdb数据库[https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downloads.jsp]，上面有各种...
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irGSEA：基于秩次的单细胞基因集富集分析整合框架（中文教程）一、背景 在单细胞转录组测序中，整合多样本数据进行分析逐渐成为一种趋势。越来越多的研究者趋于使用未校正批次效应后的数据进行差异基因分析。他们认为，校正批次效应后的数据，会掩盖...
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文献学习032--[sc+st]人类心肌梗死的空间多组学图谱1. Integrative spatial and single-cell genomics of the human heart Fig 1A： 五个患者的心脏样品，包括...
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R-clusterProfiler: GO/KEGG + 可视化常用的分析方法： 过表征分析 (over representation analysis, ORA) ：先找出差异基因，再对差异基因进行如GO/KEGG等富集 基因富集分析 ...
