目标 通过varscan等找到somatic mutations之后，想看多个样本的突变之间的交集。bcftools是用来处理vcf文件，可以进行各种相关的处理和分析。 软件...
发简信
IP属地：上海
-
bcftools 处理vcf文件，寻找多个vcf文件中突变的交集
-
Seurat中Featureplot的问题I used Featureplot to get the visualization of my srobj. I found cells were not sorted...
-
inferCNV相关思考（配对样本、多样本问题 ）由于层次聚类的问题（数据量太大的时候，层次聚类的速度很慢，同时会报堆错误，出现内存溢出），inferCNV的不能处理大批量的数据。另外，对于来源于不同病人的样本，inferC...
-
-
HPC上使用nextflow的建议
Nextflow是开发科学工作流程在HPC系统上使用的强大工具。它提供了一种简单的解决方案，以一种便携式的方式使用优雅的反应式/函数式编程模型来部署大规模的并行化工作负载。 ...
-
染色体异常与其在有丝分裂时的位置相关在细胞核中的位置预示着染色体异常 单细胞分析表明，染色体在细胞核中的 3D 位置有助于它们参与与癌症相关的基因组重排的可能性。 正常人类细胞的每条染色体都有两份拷贝。相比之下...
-
nextflow-简单训练-欢迎语
欢迎 欢迎来到 Nextflow 培训工作坊 我们很高兴能够与您一起探索使用 Nextflow 编写可重复和可扩展的科学工作流程的道路。本指南是 Nextflow 完整文档的...
-
要是有人也有相同的问题，欢迎一起吐槽
Y9000X吐槽记录
22年底买了Y9000X，i7+3060，拼多多上车。感觉这个机器的电池、厚度以及颜值都好评，但是它也有一堆毛病。（1）只要开启了legion zone的igpu的自动或者开...
-
Y9000X吐槽记录22年底买了Y9000X，i7+3060，拼多多上车。感觉这个机器的电池、厚度以及颜值都好评，但是它也有一堆毛病。（1）只要开启了legion zone的igpu的自动或者开...
-
微信公众号：office技能精选。<br>专注分享Office办公软件技能，间歇性分享一些有趣好玩的事，一个你值得关注的公众号。
-
学到了，正好需要
R语言pheatmap热图色条控制小技巧
本期介绍一个控制热图颜色范围并规定指定值颜色的小技巧。 使用的是R语言的pheatmap包，先生成随机数据： data1如下： 查看数据范围： 使用上面的矩阵做热图，要求低值...
-
@Hayley他整个数据集都卡的这么多，都50%的MT了还剩下啥
文献学习067--[sc]肝癌免疫微环境和中性粒细胞异质性
张泽民大佬刚刚online的nature，来学习一下。 原发性肝癌(primary liver cancer, PLC)有三种主要的组织学亚型-肝细胞癌(hepatocell...
-
MT比例直接卡到50%，这结果做出来真的靠谱吗？
文献学习067--[sc]肝癌免疫微环境和中性粒细胞异质性
张泽民大佬刚刚online的nature，来学习一下。 原发性肝癌(primary liver cancer, PLC)有三种主要的组织学亚型-肝细胞癌(hepatocell...
-
区分旁观者T细胞与肿瘤反应性T细胞（一）文献标题： Bystander CD8+ T cells are abundant and phenotypically distinct in human tumour i...
-
infercnv需要的R包rjags的安装
error: installing source package 'rjags' ...** package 'rjags' successfully unpacked an...
