目标 通过varscan等找到somatic mutations之后,想看多个样本的突变之间的交集。bcftools是用来处理vcf文件,可以进行各种相关的处理和分析。 软件...

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在细胞核中的位置预示着染色体异常 单细胞分析表明,染色体在细胞核中的 3D 位置有助于它们参与与癌症相关的基因组重排的可能性。 正常人类细胞的每条染色体都有两份拷贝。相比之下...
Nextflow是开发科学工作流程在HPC系统上使用的强大工具。它提供了一种简单的解决方案,以一种便携式的方式使用优雅的反应式/函数式编程模型来部署大规模的并行化工作负载。 ...
欢迎 欢迎来到 Nextflow 培训工作坊 我们很高兴能够与您一起探索使用 Nextflow 编写可重复和可扩展的科学工作流程的道路。本指南是 Nextflow 完整文档的...
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注意,这里使用的seurat对象要求已经run过runUMAMP()findCluster等函数,否则也没有必要把seurat的结果弄到monocle3的cds对象里 1. ...
1.Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing ...
前两天遇到了一个小问题:初步注释细胞发现,使用RenameIdents后细胞类型的levels与我想要的排序不符。例如,我实际得到的level为: cancer_cell1 ...
seurat自己的vlnplot出的图感觉有点丑丑的,网上找到了scRNAseq || 堆叠小提琴图(StackedVlnPlot)的4种实现方式[http://events...