Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本（2024.03.03） 增加Mmseqs2用于去冗余，基因聚类的速度非常快，且随序列量线性增长（2024.03.12...
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宏基因组分析流程（Metagenomic workflow）202405｜持续更新 -
Metagenomic workflow 宏基因组分析流程更新 查看新版：宏基因组分析流程（Metagenomic workflow）202405｜持续更新 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jiansh...
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盘点宏转录组分析方法
导读 1. 宏转录组概念： 宏转录组测序是对某一特定时期、特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序，直接获得该环境中所有微生物转录组信息的一种测序技术的新应用。宏转录...
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sortmerna 去除rRNAsortmerna是一款检测文库中rRNA含量，并去除rRNA reads的软件。当怀疑文库中包含的rRNA比例较高时，这款软件可以派上用场。以下简单介绍它的安装与基本使用方...
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KneadData质控、SortMeRNA去rRNA
导读 宏转录组数据分析第一步。 一、KneadData下载、安装、质控 链接：https://bitbucket.org/biobakery/kneaddata/wiki/H...
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学习R语言绘图，一个网站就够了
很多人想学习R语言绘图，最好的办法就是多进行操作，这里有一个非常好的网站，里面汇集了大量R语言的绘图代码，只需将这些代码复制下来多去操作就会有很好的收获。r-graph-ga...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
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iTOL进化树调图细节记录iTOL基本用法已经会了，之前记录过一点：系统发育（进化）树绘制小结[https://www.jianshu.com/p/20af7e003d19]。最近重用，调图时又发现了...
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Conterminator--检测核苷酸和蛋白质序列组中的污染
更新: 最近有看到新的软件可以检测高通量序列的污染情况---fastq_screen(https://github.com/StevenWingett/FastQ-Scree...
