jing_我愿

Non-canonical open reading frames (ORFs) 非经典的开放阅读框 the ~20,000 canonical, well-annotate...

jing_我愿

1. 不要把时间花在实验室纷争上，不想讨论实验室纷争或者霸凌的具体事件，因为95%都是鸡毛蒜皮的小事。如果关系已经崩了，那么崩了就是结局。接受这场人物关系的结局。以后言行一致...

jing_我愿

Burden 分析，是基于基因的关联分析方法中的一种，应该与基于位点的关联分析（GWAS），起到相辅相成，互相补充的作用。 传统GWAS分析，主要是利用大样本量，寻找病例对照...

jing_我愿

意思是，burden test只适用于一个基因同时有害或同时保护（必须只含一种方向），而SKAT只适用于一个基因既有害又保护（必须包含两种方向），而SKAT-O考虑了这两种思想吗？

基于基因的关联分析的简单背景说明

Burden 分析，是基于基因的关联分析方法中的一种，应该与基于位点的关联分析（GWAS），起到相辅相成，互相补充的作用。 传统GWAS分析，主要是利用大样本量，寻找病例对照...

红外线biubiu

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jing_我愿

写在前面：当学习某一重要文件格式时，更需要对此格式对应软件工具进行全面的学习（如sam/bam——samtools）。在多次花时间写脚本处理文件之后发现，80%左右的任务其实...

jing_我愿

在拿到一组snp数据时，首先应该想到要对snp数据的质量进行检测和控制。然后再考虑这组数据该怎么分析，如何分析。snp的质控是非常重要的，如果snp数据的质量不佳，那么计算的...

jing_我愿

一、定义二、indel的左对齐三、多等位位点的左对齐 定义 在二代测序中，使用bcftools call或者 gatk HaplotypeCaller工具检出变异位点的时候，...

jing_我愿

有许多不同的统计量可以衡量差异选择的区域或基因渗入障碍的区域。这里介绍常用的四个统计量的计算： pi, 衡量遗传多样性 Fst, 衡量群体分化程度 dxy, 对核苷酸多样性绝...

jing_我愿

AnnotSV地址：https://lbgi.fr/AnnotSV/[https://lbgi.fr/AnnotSV/]版本：3.0.5 AnnotSV输出结果部分列名解释 ...

jing_我愿

为什么同样的一个AnnotSV_ID，对应了无数个full注释呢？

AnnotSV输出结果列名

AnnotSV地址：https://lbgi.fr/AnnotSV/[https://lbgi.fr/AnnotSV/]版本：3.0.5 AnnotSV输出结果部分列名解释 ...

亦是旅人呐

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jing_我愿

请问这个是看full注释的吗

AnnotSV输出结果列名

AnnotSV地址：https://lbgi.fr/AnnotSV/[https://lbgi.fr/AnnotSV/]版本：3.0.5 AnnotSV输出结果部分列名解释 ...

亦是旅人呐

2406 3 6

jing_我愿

所以MantaINV和MantaBND有什么区别呢？

一文读懂SV检测软件Manta的结果文件

Manta输出VCF文件 Manta运行完毕后，将在$ {MANTA_ANALYSIS_PATH}/results/variants目录下输出一组VCF格式的结果文件。 如果...

徐广惠_6f76

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jing_我愿

灰色填充和透明填充有区别吗？为什么叫映射质量为零呢？灰色填充代表这个reads正确map到了此位置，但是透明填充显示这个reads没有对齐嘛？代表multi map或者没有map？

【基因组学】使用IGV可视化查看基因组重测序比对结果

写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化，因此广泛应用于基因组学的研究中。下面我以windows下的IGV为例，介绍一下IGV在查看基因组变异方面的应用。 一.下载 下载链...

巩翔宇Ibrahimovic

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