官方说明：https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper/wiki/eggNOG-mapper-v2.1.5-to-v2.1.8#v218...
IP属地：贵州
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Eggnog-mapper（2.1.7）使用记录 -
用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计
用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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2021-01-05重测序数据call SNP 流程
bwa+samtools+picardtools+GATK call SNP 流程[https://www.jianshu.com/p/938d362fc48d]如何利用重测...
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2022-04-14两个基因组间鉴定结果SV和SNP变异
###01.序列比对 nohup nucmer --mum -c 100 -l 50 -g 1000 -t 12 $ref $qry &> step1.log & #--mi...
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Syri：基于组装基因组的变异检测1.安装Syri GitHub页面：https://github.com/schneebergerlab/syri[https://github.com/schneeberg...
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重测序分析（4）使用GATK进行SNP和INDEL检测使用GATK进行SNP和INDEL检测GATK是 Broad 开发的用于测序数据的变异检测软件，后续推广到动植物研究中，是目前最广泛使用的变异检测软件。GATK有两种方式变异...
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检测snp和InDel的工具：snippy~可用于检测两条fasta序列之间的变异生成vcf格式文件这个软件的github主页 https://github.com/tseemann/snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 我是...
