GSDS[http://gsds.cbi.pku.edu.cn/] 是由北京大学生物信息学中心提供的用于显示基因外显子、内含子、保守元件的组成和位置的一个在线服务,全英文界面...

GSDS[http://gsds.cbi.pku.edu.cn/] 是由北京大学生物信息学中心提供的用于显示基因外显子、内含子、保守元件的组成和位置的一个在线服务,全英文界面...
写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网,手上的...
基本分析内容 • 基因家族概念• 数据库检索与成员鉴定• 蛋白成员基本特性和基因结构分析• 多序列比对和进化树分析• 保守结构域和模体分析(motif注释...
本文主要工作:对SBT基因家族的基因结构进行可视化呈现 4.2 基因结构可视化 可视化基因结构,无非就是展示基因区域的组成:3’,5’-UTR,exon或展示CDS,intr...
基因家族树构建最常用的方法是 NJ 法和 ML 方法,构建进化树之前,需要进行多序列比对。 多序列比对 多序列比对的作用是将核酸或者氨基酸序列对齐,使得相同残基的位点位于同一...
基因家族流程:基因家族分析(一) 基因家族流程:基因家族分析(二) 基因家族流程:基因家族分析(三) ====================================...
本文主要工作内容:(1)使用HMM和NCBI-CDD对基因家族进行鉴定(2)使用几个网站对基因家族表达蛋白质的简单性质进行分析 2.基因家族鉴定与基本特征探究 2.1 基因家...
1 什么是motif分析 在DNA或蛋白的同源序列中,不同位点的保守程度是不一样的,一般来说,对DNA或蛋白质功能和结构影响比较大的位点会比较保守,其它位点则不是很保守。这些...
背景 当我们使用 CentriMo 进行motif 富集后,如采用下面的命令 会在test目录产生三个文件(centrimo.html,centrimo.tsv,site_c...