「难」绝对是生命中幸福的开始,「容易」绝不是该庆幸的事。
IP属地：四川
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数据的标准化和正态化变换
Author: 杜七 一、前言 数据挖掘过程中，不同变量数据单位不一，比如，我们想知道一个人身体健康状况，其身高是180cm,体重是80kg,视力是2.5,心跳是70/min...
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生信分析之基因富集分析（GeneSet Enrichment Analysis)
01 基因富集分析基本概念 今天我们来讲一讲什么是基因富集分析 首先我们要抓住一个核心，那就是： “将我们挑出来的基因归归类，聚类分析，看看这些基因的功能和我们的研究是否具有...
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您好，请教一下，我输入在基因组范围内查找候选区间中的候选基因
中的./bedtools时，显示没有那个文件或目录是什么问题呀？12.GWAS：候选基因挖掘
在上一步确定好候选区间后，需要找到候选区间内的基因，即候选区间和参考基因组取交集，用到的工具是bedtools。 关于bedtools的详细用法，推荐这篇文章，介绍的很详细，...
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12.GWAS：候选基因挖掘
在上一步确定好候选区间后，需要找到候选区间内的基因，即候选区间和参考基因组取交集，用到的工具是bedtools。 关于bedtools的详细用法，推荐这篇文章，介绍的很详细，...
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【GWAS】为TASSEL结果绘制曼哈顿图及QQ图好久没写博文了，分享一个为TASSEL结果绘制曼哈顿图的代码： 结果如下： QQ 图的结果有点异常，请忽略。 欢迎大家大家关注「小刘哥」公众号，进行交流。
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相关性作图代码（搬运整理）1. 相关系数的显著性水平（Correlation significance levels (p-value)） 2. 相关性热图 3. 相关性图 4. 相关性分布图 参考链...
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Dell R710/R730XD 服务器安装 CentOS 8.1
2020年第一篇，好久没在简书更新文章了。 1. 机器配置 Dell PowerEdge R710 Dell PowerEdge R730xd 2. 需求 需要搭建 Slur...
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3.2 GWAS：最佳线性无偏估计量——BLUE值计算（多年单点有重复）
GWAS中使用均值、BLUP值还是BLUE值，邓飞老师有两篇帖子进行了介绍，链接如下，根据我的数据，我选择了BLUE值。在这里提醒大家，不要一上来就忽略所有warning，很...
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R语言~高级PCA分析主成分分析，不只需要找到几个虚拟但不知具体为何物的主成分因子，还需要知道我们提供的变量在各个主成分因子上的载荷（有正有负）和贡献度，以及具体保留多少个主成分因子才能既尽量保留...
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GWAS全基因组关联分析全流程
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清单，也许以后有新的方法或者...
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玉米全基因关联分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因组关联分析是基于数量性状连锁不平衡理论，通过表型与基因型关联分析获得影响表型性状的显著关联标记。 1. 软件 Tassel / Gaipt / FarmCPU / mr...
