一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析,然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可以进行GSEA,这就是ssGSEA(single sampl...
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问题描述: 同事使用终端时不下心删除了用户下的.bash_profile,然后终端提示符显示的是bash-4.2$, 而不是 [用户名@主机名 路径]$ 的显示方式,问我怎么...
Original 表观遗传学习小组 Epigenetics表观遗传学 本文根据 2016 年 8 月复旦大学倪挺教授在「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成,本文采用...
适用背景 之前写了一篇文章介绍四步完成单细胞数据调控网络流程分析[https://www.jianshu.com/p/71ed43163ce1],但生成的结果没有进行可视化,...
本次学习资料来源,结合视频观看效果更佳,视频相关代码如下: 视频如下:https://www.youtube.com/watch?v=uvyG9yLuNSE[https://...
scRNAseq免疫细胞注释: 免疫细胞注释-1:T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2:髓系细胞[http...
1. 简介 纤维化是由肌成纤维细胞在慢性炎症反应中过度沉积细胞外基质(ECM)蛋白引起的疤痕和组织硬化。多种有害刺激(包括毒素、传染性病原体、自身免疫反应和机械应激)能够诱导...
作者,追风少年i hello,大家好,今天这个日子相信大家都不会陌生吧,不知道有没有当年复读的童鞋,日子很快,恐怕高考之后,再也没有经历过高中那种炼狱的日子。 今天我们分享一...
说在前面 说到细胞分化轨迹的推断,想必很多小伙伴第一会想到的是monocle2这个软件,但是它只能做到oneshot,不能捕捉到细胞分化的动态过程。另一种高阶的算法是RNA速...