前一篇推送解读了2022年发表在DC上的关于拟南芥再生的文章。文章种利用TOBIAS鉴定了转录因子的活性。本次推送将介绍这款软件的原理及使用。 TOBIAS——2020NC ...
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生信分析7：如何利用ATAC-seq数据鉴定转录因子活性 -
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TMHMM 2.0--蛋白质的跨膜结构域预测如何预测一个蛋白是否具有跨膜螺旋（TMH）？ 蛋白结构决定蛋白功能，利用生物学在线软件工具TMHMM Server,v.2.0版本是蛋白质跨膜螺旋的在线分析工具。TMHMM是...
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关于测序数据大小问题
基本概念 我们一般说的测序数据，比方说 6G 的测序数据，这个G代表的是 Gbase，而非文件大小 GB（gigabyte)Gbase 代表的是碱基数量，即测序文件（A,T,...
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分子生物学实验常用抗生素的配制抗生素(antibiotics)是一类由微生物或其他生物生命活动过程中合成的次级代谢产物或其人工衍生物，他们在很低浓度时就能抑制或干扰他种生物（包括病原菌，病毒，癌细胞等）的...
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在热图中画的相关基因趋势线我们在做差异表达聚类的时候，往往会根据表达谱用相关R包画聚类情况，聚类图很漂亮，但是如果我想看 Q型聚类里面相关基因在各样本之间的表达趋势变化怎么办。这里教你一招： step...
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单细胞RNA-seq去除批次效应这是一篇2018年发表在NBT上的文章，讲述的是两套单细胞数据如何去除批次效应 文章链接： 前言 由于不同的实验室，以及各个技术人员手法不同，在测单细胞RNA-seq的时候往...
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分析时间序列的RNA-seq tool简介 maSigPro，这是一款可以综合分析时间序列RNA-seq的工具。这款工具最初由Conesa等人于2006年开发，于2014年经Nueda等人进一步优化而得到的 那么...
