发简信
IP属地：上海
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初入职场的生信猿，喜欢折腾代码整点有意思的东西
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质量检测：FastQC拿到测序数据后我们首先要进行质量评估（Quality Control），常用的工具就是FastQC。FastQC的详细使用说明：http://www.bioinformati...
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FastQC数据质控报告的详细解读
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号，现在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33编码 Total sequ...
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一文读懂FastQC Report前言：从今天开始就开始为拼装转录组做准备啦，今天听了技能树组织的生信人论坛，感觉很有意思。特此声明：本文所有代码及文件经通过本人亲自实践！绝对没有副作用！当然希望大家多提出宝...
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跳出生信，尝试写作的新手
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lncRNA数据处理（get fasta>>>novel lncRNA))）
情况说明：我有两个实验，每个实验两个重复，我现在要鉴定到新的lncRNA之后进行差异分析。大体思路，我会先通过常规的鉴定novel lncRNA方法鉴定到新的转录本，将转录本...
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手把手入门--DESeq2差异基因分析准备工作 需要你先安装好R-3.6.0 、Rtools-3.5、Rstudio，这是基本的运行环境。 然后再此基础上安装DESeq2 的R包。 >Install.packag...
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研究生在读，植物病原真菌致病基因功能解析&生信分析~欢迎相互交流，共同进步。
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Primer Premier 5.0引物设计PCR引物设计⑴ 确定PCR产物片段大小（product length）；⑵ 确定引物所在区段；⑶ 确定引物序列的长度范围（primer length ）；⑷ 确定引物Tm值...
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生信＋实验：最全单基因研究套路总结
随着测序技术的发展，每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长，越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测序数据的意义。已有很多研究表明，某个基因可能参与了某种肿瘤的...
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高通量测序中的接头（adapter）到底是什么主要参考 祝让飞 的文章及 Tufts 网站中的信息，特此致谢。 首先放一张测序示意图，在DNA片段两端所加的序列即接头序列，也就是我们今天要讲述的主角。 1 基本概念 1....
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生信分析学习笔记 - RNAseq （五） HISAT2回帖及评估声明：本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记，不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理，序列回帖到数据可视化...
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科学院小硕一枚<br>细胞生物学专业<br>爱好摄影
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4、RNAseq(4)--Hisat2进行序列比对及Samtools格式转化概况：使用处理后的fastq文件和基因组与转录组比对，确定在转录组或者基因组中的关系。在转录组和基因组的比对采取的方案不同。分别是ungapped alignment to ...
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