拿到测序数据后我们首先要进行质量评估(Quality Control),常用的工具就是FastQC。FastQC的详细使用说明:http://www.bioinformati...
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拿到测序数据后我们首先要进行质量评估(Quality Control),常用的工具就是FastQC。FastQC的详细使用说明:http://www.bioinformati...
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号,现在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33编码 Total sequ...
前言:从今天开始就开始为拼装转录组做准备啦,今天听了技能树组织的生信人论坛,感觉很有意思。特此声明:本文所有代码及文件经通过本人亲自实践!绝对没有副作用!当然希望大家多提出宝...
情况说明:我有两个实验,每个实验两个重复,我现在要鉴定到新的lncRNA之后进行差异分析。大体思路,我会先通过常规的鉴定novel lncRNA方法鉴定到新的转录本,将转录本...
准备工作 需要你先安装好R-3.6.0 、Rtools-3.5、Rstudio,这是基本的运行环境。 然后再此基础上安装DESeq2 的R包。 >Install.packag...
PCR引物设计⑴ 确定PCR产物片段大小(product length);⑵ 确定引物所在区段;⑶ 确定引物序列的长度范围(primer length );⑷ 确定引物Tm值...
代码如下
随着测序技术的发展,每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长,越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测序数据的意义。已有很多研究表明,某个基因可能参与了某种肿瘤的...
主要参考 祝让飞 的文章及 Tufts 网站中的信息,特此致谢。 首先放一张测序示意图,在DNA片段两端所加的序列即接头序列,也就是我们今天要讲述的主角。 1 基本概念 1....