作者，Evil Genius 我们来分享一下关于WES分析部分的内容，其中内容主要包括三部分 基础部分，包括WES数据的call SNP、INDEL、MSI、fusion、a...
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外显子（WES）panel分析基础篇 -
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TWAS（fusion）最近在看遗传数据与表达结合的东西，介绍一个经典的方法吧，fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches for large-scal...
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2022《Cell》 作物驯化与育种中的整合基因组学导读 野生植物被成功地驯化为农作物是人类文明的大事件。该过程的成功很大程度上要归功于持续的人工选择。本文总结了过去十年在作物驯化和育种研究中的新发现。作物基因组图谱的构建和众...
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bulk RNA-Seq （2）比对到参考基因组欢迎关注Bioinfor 生信云！ 上一篇推文讲了bulk RNA-Seq 的数据清洗部分，接下来就是将清洗后的数据比对到参考基因组上（有参）。如果没有参考基因组，那么就需要...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
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bcftools就可以，多此一举
修改vcf文件中的样本名称
很多时候，call完变异后，需要对vcf文件中的样本名进行修改，小编这里分享一个修改ID的python脚本(若vcf比较大，建议只对表头进行修改，然后cat在一起)： 注：c...
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SNP calling及fst值的计算此处与云养江停的文章有略微差距 一.SNP calling 参照文章gvcf文件与vcf文件 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...
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BSA分析-实战笔记(四)下游分析参考文章：以水稻为例教你如何使用BSA方法进行遗传定位（中篇）[https://www.jianshu.com/p/9d842eac5c32] 一、准备工作 需要安装devt...
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Python | argparse
参考：博客园 | Python解析命令行读取参数 -- argparse模块[https://www.cnblogs.com/arkenstone/p/6250782.htm...
