优雅地做一名极客
发简信
IP属地：湖北
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target数据库初探在简书上看了很多文章，有很多收获，但自己从来没写过。 生信有很久没碰了，因为需要，又一次捡了起来。 之前在TCGA数据库一直没有找到骨肉瘤的临床数据，不能把基因表达和临床预后...
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请问你的R是在什么平台运行的呀，是哪个版本啊？我运行到 runscenic2那一步会报错，
RcisTarget: Prunning targets
Error in file(con, "w") : 所有链结都已在运行
你知不知道这是什么原因呢？R包SCENIC:结果可视化与分析
1.鉴定细胞状态 以t-SNE图呈现AUC评分和TF表达情况（即调控元件的活动度） 利用AUC 交互app（Scope） logMat <- exprMat # Better...
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可以告知一下你r的平台和版本吗？
R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
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可以问一下你运行的环境和scenic等软件的版本吗？
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
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我也遇到了同样的问题，我怀疑是windows环境的原因，不知道换成linux或者mac能否解决这个问题。
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
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你好，想请教下single cell signature viewer这个软件是必须在windows电脑上同时使用解压的软件， Python，和R studio才能使用吗？ 有没有别的可以用R就能跑的KEGG通路可视化的包呀？
【Selenium框架1】实现Single-Cell Signature Viewer的自动化保存图片文件
Signature浏览器的简单介绍文献：Single-Cell Signature Explorer for Comprehensive Visualization of S...
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很厉害，虽然还有很多不太懂，但还是有很大收获
单细胞好文1--Tracing tumorigenesis in a solid tumor model at single-cell resolution
前言 我在2019年3月份写过一篇这样的文章（一文读懂scRNA-Seq）到底要花多久时间才能看懂一套单细胞测序数据结果？，并在文末许诺，对PPT感兴趣的小伙伴可以留言询要P...
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（一文读懂scRNA-Seq）到底要花多久时间才能看懂一套单细胞测序数据结果？
（一文读懂scRNA-Seq）到底要花多久时间才能看懂一套单细胞测序数据结果？
先说我的态度。 最快的捷径就是没有捷径，踏踏实实搞学问 我一直相信慢工出细活（当然我写推文都不怎么想回头检查错别字），要学习什么东西，稳扎稳打才是最快的捷径，不求甚解要建立在...
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非常喜欢你的单细胞交响乐系列，跟着原文学很累，看你的轻松很多，可以继续做下去吗？
单细胞交响乐3-scRNA的细胞质控
刘小泽写于19.12.3-4 ，更新于2020-06-26为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-理解scRNA常用的数据结...
