相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用，这儿，针对我自己对SCENIC的学习使用，遇到的问题做一个详细的讲解说明，希望能对大家理解学习应用SCENIC起到一些帮助。 SC...
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单细胞转录调控网络分析工具（TF，motifs）-SCENIC -
10X单细胞（10X空间转录组）分析回顾之一些细节绘图操作临近年底，我们要总结，马上回家了，大家今天到底挣了点什么？？反省一下，今天的自己，有没有更优秀，这一篇我给大家分享一些单细胞分析图片的细节操作，图片是我们分析结果的展示，要美...
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10X单细胞（10X空间转录组）多组学（RNA + ATAC）推断Velovyto（MultiVelo）hello，大家好，今天我们来分享多组学数据推断RNA Velocyto，大家做velocyto的时候估计都是用RNA数据来分析的，其实，对应的ATAC数据也含有丰富的动力学...
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组间差异检验，终于有人讲清楚了!什么是组间差异检验？就是组间的差异分析以及显著性检验，应用统计学上的假设检验方法，检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲，所有的差异检验都基于一个假设：组间没有差异，变量之...
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简书笔记汇总
以下是我简书里所有的文章链接，按不同的专题分类，方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Linux命令行与shell脚本编程...
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单细胞数据用Harmony算法进行批次矫正
Harmony 整合单细胞RNAseq数据进行批校正和后续分析 System requirements Harmony必须在R版本3.4以上运行，支持 Linux, OS X...
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单细胞转录数据分析之ScanpyScanpy 是一个基于 Python 分析单细胞数据的软件包，内容包括预处理，可视化，聚类，拟时序分析和差异表达分析等。https://genomebiology.biom...
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Seurat 4.0 || WNN整合scRNA和scATAC数据前情回顾 Seurat 4.0 ||单细胞数据分析工具箱有更新[https://www.jianshu.com/p/48e4f61e3a84]Seurat 4.0 ||单细胞...
