这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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我的生信自学心得分享
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Guide to Fusion Tags这篇笔记是wet实验的笔记，记录了一些有关融合标签的知识点。因为之前没有做过相关实验，在和实验室同学讨论的时候闹了个笑话。。。于是必须把这部分知识补起来。学习材料来源于abc...
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10X Cell Ranger ATAC 算法概述Barcode Processing 执行此步骤是为了修复条形码(barcode,细胞的标识)中偶尔出现的测序错误，从而使片段与原始条形码相关联，从而提高数据质量。16bp条...
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10X单细胞测序分析软件:Cell ranger单细胞测序有着漫长的过去，却只有短暂的历史---谁说的！ 说她漫长是因为到如今也有十几年的历史了，说她段短暂是因为针对单细胞的分析工具越来越有意义开发周期却越来越短。一般生物...
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R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
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NGS生物信息分析培训心得
刚过去的半个月，去武汉参加了陈连福的NGS生物信息分析培训，有很多心得，想记录下来。 培训简介 为什么要参加培训想多学点生物信息学技能，增加自己的竞争力.因为自己喜欢编程，又...
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conda的安装与使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信软件都可以通过conda安装，省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件，conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
