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2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera从NCBI的SRA数据库中下载原始测序数据记录下下载过程，为自己和后人避坑。 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题。即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错。 尝试了很...
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2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera从NCBI的SRA数据库中下载原始测序数据记录下下载过程，为自己和后人避坑。 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题。即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错。 尝试了很...
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哈哈哈，没错，也就看看
Perl编程练习—双重哈希、哈希数组
前几天晚上在练习Perl编程时突然顿悟了以前一直迷惑的哈希数组。对这一类的问题的解决瞬间开拓了新思路。这两天利用双重哈希/哈希数组解决了一些数据转换中的一些小问题。记录分享一...
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双重哈希看着有点晕😇
Perl编程练习—双重哈希、哈希数组
前几天晚上在练习Perl编程时突然顿悟了以前一直迷惑的哈希数组。对这一类的问题的解决瞬间开拓了新思路。这两天利用双重哈希/哈希数组解决了一些数据转换中的一些小问题。记录分享一...
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190926【R语言作图】实时定量PCR(RT_PCR)① 输入ct值，直接导出带误差线的柱状图。② 使用到的R包，"pcr",官方包的安装和使用教程详见：https://www.rdocumentation.org/packag...
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stringtie merge与gene_id1.不进行merge的pipeline stringtie官方说明文档中说明如果对新的异构体不感兴趣，可以使用下面简单的pipeline进行定量，而不进行merge 也就是说...
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或者是bed文件里染色体编号和gff文件中染色体编号不一样
jcvi作图二（共线性）
一：数据准备 还是用到上一步生成的ath.aly.anchors和ath.aly.anchors.new文件 1. 创建如下三个文件 seqids: 需要展现哪些序列 lay...
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北京基因组所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最优，搜索全局最优
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STEP4: 得到表达矩阵的流程SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 这几个步骤而已，中间穿插一些质控的手段，每个步骤选择好合适的软件即可。可以参考：一个植物转录组项目的实战 http://www...
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<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.cnblogs.com%2Fwangprince2017%2F" target="_blank">https://www.cnblogs.com/wangprince2017/</a> 博客园<br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Fu010608296" target="_blank">https://blog.csdn.net/u010608296</a> CSDN<br><br>学者网<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fwww.scholat.com%2Fwangchuang" target="_blank">http://www.scholat.com/wangchuang</a><br><br>研究之门ReseearchGate<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.researchgate.net%2Fprofile%2FWang_Chuang9" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Wang_Chuang9</a><br><br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbbs.sciencenet.cn%2Fhome.php%3Fmod%3Dspace%26uid%3D944416%26view%3Dwc12436109" target="_blank">http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=944416&view=wc12436109</a> 科学网
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48个实用的生信在线工具
在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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