记录下下载过程,为自己和后人避坑。 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题。即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错。 尝试了很...
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① 输入ct值,直接导出带误差线的柱状图。② 使用到的R包,"pcr",官方包的安装和使用教程详见:https://www.rdocumentation.org/packag...
1.不进行merge的pipeline stringtie官方说明文档中说明如果对新的异构体不感兴趣,可以使用下面简单的pipeline进行定量,而不进行merge 也就是说...
SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 这几个步骤而已,中间穿插一些质控的手段,每个步骤选择好合适的软件即可。可以参考:一个植物转录组项目的实战 http://www...
在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点,轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...
Y叔的RNA-seq workflow 强力推荐[https://github.com/twbattaglia/RNAseq-workflow]生信技能树讲解[https:/...
昨天几乎一整天都耗在了安装clusterProfiler 的坑里,简单的总结下吧。 clusterProfiler 是Y叔写的一个R包,这个R包在R中用install.pac...