HiCExplorer[https://hicexplorer.readthedocs.io/en/latest/index.html] 1、数据比对bowtie2 注意：1...
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HiCExplorer使用
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【三维基因组】多组学可视化之washU说到三维基因组可视化，就不得不说一下washU（http://epigenomegateway.wustl.edu/）了。washU相当于IGV的升级版，一向被三维基因组CN...
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homer 处理HiC-pro的结果写在前面，得到HiC-pro的结果后，我们想看看显著的互作区域以及两个样本互作区域的不同. 关注正常染色体 比较不同实验组数据大小，如果相差比较大，利用shuf随机提取等量数...
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AB区室计算【juicer/homer】
Tips： 目前主流的计算AB区室工具: juicer/homer/cworld juicer: 第一篇HiC文章实验室提供的工具,计算多个分辨率每个bin的PC1 值，但是...
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「基因组」着丝粒和端粒鉴定软件
最近状态不佳，连续两件事情做的时候只想到了一半，做了又等于没做，都成了自己预想的最差的结果，要想做到最佳，只有重做，现在浪费时间结果不合适等于白做。一心多用，今天白搞一下午，...
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quarTeT:Telomere-to-telomere Toolkit(一款多功能软件。)
功能 参考引导的基因组组装 1.AssemblyMapper: reference-guided genome assembly 基于长读长的填缝 2.GapFiller: ...
