Burden 分析，是基于基因的关联分析方法中的一种，应该与基于位点的关联分析（GWAS），起到相辅相成，互相补充的作用。 传统GWAS分析，主要是利用大样本量，寻找病例对照...
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基于基因的关联分析的简单背景说明
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单细胞之富集分析-5：一张图展示多组富集分析结果单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...
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MAGMA软件实现gene-based & gene-set-based关联分析
作者：Bio_gevin审稿：童蒙编辑：amethyst 随着全基因组关联分析使用样本数量的增加，人们也逐渐认识到很多感兴趣的性状在本质上是由微效多基因控制。单个SNP的关联...
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GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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单细胞数据挖掘实战：文献复现（一）批量读取数据最近开始接触单细胞数据，网上也有很多学习资料，琳琅满目，我也挑了一些视频资料进行学习，不过感觉还是需要进行实战训练才能更好地掌握这些知识，所以选了一篇2021年发表在natu...
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GWAS全基因组关联分析全流程
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清单，也许以后有新的方法或者...
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手把手教你做单细胞测序数据分析（三）———单样本分析
这一部分课程正式开始学习单细胞转录组测序的数据分析，大家无需担心自己的R语言方面的编程基础。本次课程将从分析工具包的安装、加载开始，对脚本的参数进行全方位的讲解。具体分...
