学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
发简信
IP属地：湖南
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楼主你好，请问如何进行enrichKEGG分析，enrichKEGG功能并没有导入本地db的功能啊
测序了，然后呢（四）有了OrgDb才能进行富集分析
刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类，OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系，以及基因与G...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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请教，用这个包做db的时候，包本身带的GO.DB太老，自己的数据注释的GOID在这个包的GO.DB中找不到，从而被过滤掉了。比如4万个基因，最后做成db后发现只有2.4万个基因。这个问题如何解决？运行的时候会报出这个信息‘Dropping GO IDs that are too new for the current GO.db’，楼主有没有注意最后做出来的db有多少个基因在里面？拟南芥可能好一些
「Bioconductor」让我们愉快的为自己做一个物种包吧
做植物是一件比较艰苦的事情，不但资源少，而且有限的资源未必还能用的好，就拿Bioconductor上的注释包来说吧，我在「Bioconductor」不要轻易相信Annotat...
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