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一键解决不同物种间的直系同源基因的转换 今天推荐一个数据库网站,可以直接在网站上进行转换,比如我们就知道果蝇这个物种,他们自己的名字名命就是和别的物种不一样,总有一些自己的叫...
双阈值火山图 #######双阈值图library(ggplot2)logFC_t1 = 1P.Value_t1 = 0.05logFC_t2 = 2P.Value_t2 =...
ceRNA 最近被玩的很多,构建的方法很多,这个是我这几天探索觉得比较好用也比较省力的,分享给大家。我已经把代码 数据 文件打包好了,在生信星球公众号后台回复ce657即可获...
杀杀 使用cibersort报错了,提示warning,还有cibersort Error in h(simpleError(msg, call)): 在为'sort'函数选...
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安装pheatmap包创建测试矩阵画个热图显示色块的数值或文本调整色块或文本大小行列注释列名的文本角度调整切分热图自定义显示哪些行列的名字用距离矩阵的方法来聚类练习 1. 安...
针对测序数据和芯片数据,目前常用差异分析的R包有edgeR、limma、DESeq2,做一简单比较,方便平时分析。内容多为搬运,主要方便下次寻找。 1. 三种分析方法的比较 ...
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1、Cibersort.R2、LM22.txt3、genes_exp.txt 1、Cibersort.R 此文件为源代码,在使用之前请阅读一下代码中的注释段,安装一下前置包在...
1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly, all expression data should be non-negative, ...