看过很多GEO数据挖掘的教程,一直都是芯片数据举例。我自己也根据流程(Taolu)分析过好几个geo芯片数据。一直有个疑惑, GEO上都是芯片数据吗? GSE开头的都是芯片数...

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与传统的Over Representation Analysis: the up- or down-regulated DEGs和Gene Set Enrichment An...
归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个...
表达数量性状位点(expression quantitative trait locus, eQTL)是一类能够影响基因表达量的遗传位点(大部分都是单核苷酸多态性,SNP),...
引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段,彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析(Genome Wide Association ...
用clusterProfiler做其实够用了,网页在线做没多大必要,能够起起对照作用吧。网页在线做,后续挑出自己想要的模块,会方便一些,但自己用包做手动挑也还好。记录这篇,...
常规3个验证思路: 1)高通量的生信数据挖掘的结果,用低通量的实验技术去验证,也就是我们常规说的,qCPR,WB/IHC简单验证下筛选出hub gene或者单基因的表达水平(...
在转录调控相关的文献中,我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络(protein protein interaction network,PPI network)。具体而言,...
一边学习,一边总结,一边分享! 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码一[https://mp.weixin.qq.com/s/M0LAlE-6...