生信师姐

MUMmer出现的历史背景测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方式搜索数据...

风知秋

该系列主要介绍了 MUMmer 软件下核苷酸序列比对程序 nucmer 的使用，计算操作见前两篇推文； 序列比对软件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...

卢大命

导读 本文适合知道NUMA这个词但想进一步了解的新手。 以下的文章内容包括：NUMA的产生背景，NUMA的架构细节和几个上机演示的例子。 NUMA的诞生背景 在NUMA出现之...

半夜一更

格式 sam文件是短序列比对生成的文件，是二代测序中最核心的文件。在RNAseq，变异检测等分析中，都需要首先生成sam文件格式。bam文件是sam格式的二进制格式，转换为二...

不会停的蜗牛

BERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers) 10月11日，Google AI Languag...

半夜一更

转录组(transcriptome)，广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。转...

xuzhougeng

SAM及其相关工具 SAM格式介绍 SAM全称是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比对或联配数据的格式。无论是重测序，还是转录组，还是表观组，...

Nickier

--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。能够实现二进...