convert bed to gtf 1.使用conda安装bedtogenepred和genepredtogtf包 conda install -c bioconda uc...
判断语句 if 语句: 单分支 语法:if 条件判断: 输出的内容 if - else 语句: 双分支 语法:if 条件判断: 输出的内容else: 输出的...
生信分析中最常见的数据格式应该就是fastq了。我们最初拿到的数据也是fastq格式。通常情况下,原始下机数据经过拆分之后获得的数据中会包含有低质量、N(未知碱基)、接头序列...
目标: 根据下载的GTF文件,利用bedtools提取基因组的不同区域。 实例: 见参考的网站 参考: 1、https://davetang.org/muse/2013/01...
这篇文章很长,超过1万字,是本系列中最重要的一篇,因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读,对于有一定经验的老手来说,相信依然可以有...
虽然有人写的挺好的了最全Bedtools使用说明--只看本文就够了 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/f8bbd51b...
请问怎么把DMR注释到TE上呀
R语言 -- 寻找差异甲基化区域(DMR)-- DSS 包最好的文档其实还是官方文档。。。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DS...
基因组中重复序列大体分为两类:串联重复(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可预测)散在重复(Dispersed repeats),...
最好的文档其实还是官方文档。。。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DS...