目录介绍环境配置OrthoMCL使用统计聚类结果最后 介绍 OrthoMCL是一款直系同源基因聚类软件, 它不仅能得到多个物种共有的直系同源基因, 还能够分别获得不同物种特有...
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选择单峰模型还是线性模型?
文献标题:Count: evolutionary analysis of phylogenetic profiles with parsimony and likelihoo...
提到寻找物种之间的同源基因,大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/) ,OrthoMCL是现在用的最多的一款来找直系同...
1.前期准备 构建贝叶斯树需要用到的软件有phylosuite(序列准备)、iqtree2(最适模型查找)、mrbayes(构建贝叶斯树)。 2.phylosuite准备序列...
pheatmap是绘制热图的经典R包。其中一些细节参数设置,之前每次遇到都是网上搜索。这次系统整理下常用用法,为以后绘图提供方便。 0、示例数据与R包加载 (1)模拟示例数据...
一、中性学说 分子水平上,生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的,而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引起的,从而形成分子水平上的进化性变化或种内变异。分子演化的...
参考文章:1.https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050[https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050]2....
-3.仅作笔记使用 我所用到的所有脚本可以+Q 840842906索 简单介绍一下方向也可以,说不定以后能互相帮忙~ 注明来意,请实名 学校+名字 -2.两组样品,目的是通过...