目录介绍环境配置OrthoMCL使用统计聚类结果最后 介绍 OrthoMCL是一款直系同源基因聚类软件, 它不仅能得到多个物种共有的直系同源基因, 还能够分别获得不同物种特有...
发简信
IP属地：湖北
-
「生信」同源基因分析——OrthoMCL -
-
Count分析基因Gain/Loss/Duplication文献标题：Count: evolutionary analysis of phylogenetic profiles with parsimony and likelihoo...
-
OrthoFinder寻找同源基因并建树提到寻找物种之间的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/） ，OrthoMCL是现在用的最多的一款来找直系同...
-
MrBayes构建贝叶斯树
1.前期准备 构建贝叶斯树需要用到的软件有phylosuite(序列准备)、iqtree2(最适模型查找)、mrbayes(构建贝叶斯树)。 2.phylosuite准备序列...
-
R-热图-pheatmappheatmap是绘制热图的经典R包。其中一些细节参数设置，之前每次遇到都是网上搜索。这次系统整理下常用用法，为以后绘图提供方便。 0、示例数据与R包加载 （1）模拟示例数据...
-
群体遗传学-选择清除分析一、中性学说 分子水平上，生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的，而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引起的，从而形成分子水平上的进化性变化或种内变异。分子演化的...
-
扩增子分析——usearch+vsearch+qiime1
参考文章：1.https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050[https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050]2....
-
宏基因组 - (1)基因预测与基因相对丰度的计算-3.仅作笔记使用 我所用到的所有脚本可以+Q 840842906索 简单介绍一下方向也可以，说不定以后能互相帮忙～ 注明来意，请实名 学校+名字 -2.两组样品，目的是通过...
