单倍型分析理论上来说，单倍型的类别是2N，但由于LD的存在，会使得单倍型的类别远远的小于2N，但是如果当N的数目很大，即便是类别少，在整个群体中进行分类也会有很多种单倍型。这...
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单体型图谱简介（2）Tag SNP 理论上，研究者通过对全部一千万个SNP位点都进行基因分型，也能够寻找到这样的区域。但是，目前用这种方法进行检定的成本是过于昂贵。 单体型图谱分析内容 大多数染...
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单体型图谱简介（1）单体型概念及起源 单体型的概念 一个染色体区域中所有相关联的SNP等位基因的集合或位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点被称为一个单体(haplotype)。 如：...
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一文总结：双荧光素酶实验的原理、应用及详细步骤想验证miRNA与靶基因的作用? ——双萤光素酶报告基因检测 想了解miRNA和lncRNA/circRNA的靶向互作?——双萤光素酶报告基因检测 想知道转录因子对下游基因的...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
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TBtools - 已有插件列表
写在前面 最近我主要在忙两个事情： 了结学校里相关的一些事情，也整理下手上的资料和文件 看看是否有合适的工作 写了一段关于找工作的感悟，不过还是删了，哈哈。多数无益，回到主题...
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基因在染色体上位置可视化感谢CJ大神的反复修改，这个功能越变越好了！本文旨在复现CJ大神推文内容，具体请参考“省心炸鸡”，手动狗头（https://www.jianshu.com/p/b9034ce...
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