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安装包的代码 Biocounductor 包 Cran 包 查看R包下面都有什么函数: 加载常用的包
环境初始化 读入差异分析后结果 画图
环境设置 自定义下载GEO的函数 downGSE <- function(studyID, destdir = destdir) { ##destdir-->之后要存储数据的路径
library(Biobase)library(GEOquery) Download GPL file, put it in the current directory, a...
这是生信技能书的更加详细的汇总:https://www.jianshu.com/p/f6906ba703a0[https://www.jianshu.com/p/f6906b...
R语言中排序有几个基本函数:sort()、rank()、order()、arrange() sort()函数是对向量进行从小到大的排序 rank()函数返回的是对向量中每个数...
多线程计算 查看电脑当前核数 初始化10核心集群 差异分析-mRNA#### 数据加载 根据列名区分肿瘤组和对照组 差异分析 edgeR 提取所有差异分析结果 提取筛选后的结...
GEO数据的获取(全文用的是GSE17708这个数据)这里面是芯片数据的处理 读取下载好的文件 生成group_list以便后面使用 保存重要的赋值数据生成一个Rdata: ...