制作string的输入数据 准备cytoscape的输入文件
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07_string
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06_anno
富集分析考验网速，因此给大家保存了Rdata 上课运行示例数据无需修改，在做自己的数据时请注意把本行之后的load()去掉 1.GO datab...
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（六）05_vocano_heatmap此脚本无需修改，认清输入数据即可 1.火山图,输入数据是deg 取差异基因做热图 作热图
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（五）04_DEG差异基因第一，同样的，清除变量+加载之前的数据 差异分析，用limma包来做 需要表达矩阵exp和group_list分组对象，不需要改 为deg数据框...
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(四) 03_PCA降维和heatmap热图PCA降维——第一步，将exp数据转置，降维为甚需转置呢？ 第二步，PCA降维 dim1和dim2分别代表什么？ 热图——第一步，数据准备 第二...
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（三）02_group_ids分组和芯片注释
group_list分组 第一步：清除之前所有变量+加载之前的数据 第二步，确认分组的目标 第三步，分组向量生成 第四步，设置因子 芯片注释 芯...
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（二）01_start_GEO.RGene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库，设计初衷是为了收集整理各种表达芯片...
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（一）GEO分析相关R包下载和加载——DAY2
背景知识 hgu133plus2.db1.注释包的作用：基因芯片给出的分析结果都是针对芯片探针组的，每个探针组只有一个公司自己定义的ID，既没有...
专题公告
全过程详细步骤解析，全部代码提供。欢迎交流讨论。
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