我们前面四次教程，已经完成单细胞数据的预处理了，包括质控，归一化，高可变基因筛选，降维。现在，我们就要开始单细胞测序的正式分析了，细胞类型注释等，在开始介绍细胞类型注释前，我...
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单细胞测序最好的教程（五）：聚类 -
单细胞测序最好的教程（四）：降维前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的预处理的一些思想。关于omicverse的使用文档与安装教程可以参考我们的readthedo...
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单细胞测序最好的教程（三）：特征基因选择前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的质控以及归一化的一些思想。关于omicverse的使用文档与安装教程可以参考我们的readt...
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单细胞测序最好的教程（二）：归一化1. 背景 在前面的教程中，我们从数据集中删除了低质量的细胞，包括计数较差以及双细胞，并将数据存放在anndata文件中。由于单细胞测序技术的限制，我们在样本中获得RNA的时...
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单细胞测序最好的教程（一）：质量控制目前，国内对于单细胞测序分析的教程五花八门，百花齐放，一个合适且准确的pipeline对于分析是很有价值的。2023年在 Nat Rev Genet上发表的一篇论文Best ...
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Python版WGCNA分析和蛋白质相互作用PPI分析教程在前面的教程中，我们介绍了使用omicverse完成基本的RNA-seq的分析流程，在本节教程中，我们将介绍如何使用omicverse完成加权基因共表达网络分析WGCNA以及...
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Python版RNA-seq分析教程：DEseq2差异表达基因分析Bulk RNA-seq 分析的一个重要任务是分析差异表达基因，我们可以用 omicverse[https://github.com/Starlitnightly/omicv...
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Python版RNA-seq分析教程：差异表达基因分析Bulk RNA-seq 分析的一个重要任务是分析差异表达基因，我们可以用 omicverse[https://github.com/Starlitnightly/omicv...
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OmicVerse: 解决整个转录组学分析的Python框架2023年6月7日，来自北京科技大学，清华大学与中山大学的研究者在biorxiv上发布了一篇题为“OmicVerse: A single pipeline for explo...
