发简信
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自给的安全感才是一段感情的底气？
马薇薇在《奇葩说》中的一句话：“在爱你的过程中，有些人变成更强壮更智慧的自己，故而一念成佛，有些人变成更猥琐更不堪的自己，一念成魔。在爱的过程中，是佛是魔，历尽你给我...
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TCGA生存模型的构建以及模型预测和评估生存模型的构建方法包括：1. Lasso回归；2. Cox多因素回归；3. 随机森林；4. 支持向量机 可以把log_rank_test或cox筛选出的基因单独做模型构建，也...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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R语言获取 GO/KEGG 中某一通路的基因集
有时候我们想看某一特定通路的富集情况，这时就需要获取该通路的基因集。 一、从 GO 中获取 下载脚本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
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技能帖 | 基因ID和基因名如何快速互换，三分钟即可做到
在我们进行组学数据分析或者看别人给我们的数据报告的时候，经常会看到诸如ENSG00000141738 之类的名称，面对这样的名称，我们往往是得不到任何信息的，更不可能把这样的...
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Nomogram(诺莫图/列线图)在R中的实现本笔记来源于CSDN论坛楼主 anshiquanshu[https://blog.csdn.net/anshiquanshu] 的帖子：R绘制Nomogram图的学习笔记[h...
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R|ifelse、which、%in%的用法
转载自蓝迪的博客:R中ifelse、which、%in%的用法 在R学习过程中，遇到了ifelse、which、%in%，下面分别举例，说明他们的用法。 1、ifelse i...
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R语言读写excel文件2021.2.241、读取excel文件 1.1 读取单个excel文件 直接用read.table()读取excel文件, 读取从excel复制的剪贴板数据，再用read.table()读取...
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python
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语法，库介绍，效率
