生存模型的构建方法包括：1. Lasso回归；2. Cox多因素回归；3. 随机森林；4. 支持向量机 可以把log_rank_test或cox筛选出的基因单独做模型构建，也...
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TCGA生存模型的构建以及模型预测和评估 -
TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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R语言获取 GO/KEGG 中某一通路的基因集
有时候我们想看某一特定通路的富集情况，这时就需要获取该通路的基因集。 一、从 GO 中获取 下载脚本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
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技能帖 | 基因ID和基因名如何快速互换，三分钟即可做到
在我们进行组学数据分析或者看别人给我们的数据报告的时候，经常会看到诸如ENSG00000141738 之类的名称，面对这样的名称，我们往往是得不到任何信息的，更不可能把这样的...
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Nomogram(诺莫图/列线图)在R中的实现本笔记来源于CSDN论坛楼主 anshiquanshu[https://blog.csdn.net/anshiquanshu] 的帖子：R绘制Nomogram图的学习笔记[h...
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R|ifelse、which、%in%的用法
转载自蓝迪的博客:R中ifelse、which、%in%的用法 在R学习过程中，遇到了ifelse、which、%in%，下面分别举例，说明他们的用法。 1、ifelse i...
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R语言读写excel文件2021.2.241、读取excel文件 1.1 读取单个excel文件 直接用read.table()读取excel文件, 读取从excel复制的剪贴板数据，再用read.table()读取...
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终于，我也出了篇R语言入门手册！1 什么是R语言R语言是一个开源的数据分析环境，起初是由数位统计学家建立起来，以更好的进行统计计算和绘图，这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。由于R可以通过安装扩展包（P...
