公共数据库中的SRA 单细胞转录组数据究竟包含了哪些数据？CellRanger怎样利用10x平台下机数据进行下游一系列分析？这篇文章简单记录CellRanger 包括的主要分...
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单细胞测序分析上游cellranger软件入门介绍 -
单细胞测序上游分析-从原始数据到cellranger定量单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c216] 为避免造成环境污染，建议使用conda创建隔离环境进行...
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Smart-seq2上游分析（kallisto版）
尽管10Xgenomics已经占据了单细胞测序的主流市场，Cellranger工具的开发也一站式解决了单细胞数据上游分析的难题。但是Smart-seq2仍然具有独特的优势，并...
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跟着Cell学单细胞转录组分析(五):单细胞转录组marker基因鉴定及细胞群注释
书接上回（跟着Cell学单细胞转录组分析(四):单细胞转录组测序UMAP降维聚类[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng...
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顶刊精读 | 张泽民院士团队最新文章，时空单细胞解析免疫疗法反应下的癌症细胞动态Basic Information 英文标题： Spatiotemporal single-cell analysis decodes cellular dynamics u...
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10+生信，基于 Ro/e 发现不同治疗反应患者 CD8Teff 细胞比例差异。细胞丰度分析识别关键细胞目前在高分文章中很常见！01一、文章信息 发表杂志名称：Molecular Biomedicine 中文标题：单细胞 RNA 测序鉴定 CD8 效应 T 细胞活化作为三阴性乳腺癌免疫治疗的预测生物标...
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单细胞组织偏好性分析 Ro/e OR
the ratio of observed to expected cell numbers (Ro/e)用于定量组织富集程度，可发现细胞群不同的组织偏好性。也可以看分组的细...
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全网最实用 TRUST4利用bulk RNA-seq数据分析BCR（一）
最实用是因为我自己跑的！！说一下用到的是linux和R(4.1.0) 第一步 TRUST4安装与参考序列下载 首先咱先安装一下TRUST4 我是用conda装的 ``` co...
