https://github.com/mjnueda/maSigPro/[https://github.com/mjnueda/maSigPro/]https://rdrr....
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用PLS和OPLS分析代谢组数据简介例1. 不同品种代谢产物OPLS-DA loading plot1 安装2 内置数据介绍 代谢物对个体性别的定性响应 - PLS执行PLS-DA结果参数解释模型评估常用可...
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用ropls进行代谢组PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析
简介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对变量数超过样本数量或变量之间存在多重共线性的组学数据进行可视化、回归、分类和特征选择的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘...
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使用MetaboDiff包分析非靶向代谢组数据最近手里有个非靶向代谢组的数据，通过学习MetaboDiff包来熟悉代谢组分析的思路和流程，接下来的流程来自于MetaboDiff包官方帮助文档。 1. MetaboDiff...
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【代谢组学技术】应用于代谢组学中的技术及化学计量方法
主要内容： 1. 应用于代谢组学中的技术概述 2. 核磁共振波谱法（NMR） 3. 质谱（MS） 4. 液相色谱—质谱联用（LC-MS） 5. 气相色谱-质谱联用（GC-MS...
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muma-代谢组学单变量和多变量统计分析R包title: muma-代谢组学单变量和多变量统计分析R包date: 2019-02-23 21:38:55tags: [单变量, 多元统计, R包]categories: ...
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MetaboAnalyst：代谢组学PCA，OPLS-DA分析网站：https://www.metaboanalyst.ca/[https://www.metaboanalyst.ca/]Click here to start Stat...
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MAIT-液质联用代谢组学数据分析全能包@我的博客：有味 导读 目前用于代谢组学数据的液相色谱和质谱分析的工具只涵盖有限的处理步骤，而在线工具很难以可编程的方式使用。这篇文章作者给我们分享了一个可以用于代谢物自动鉴...
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基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)BSA作为基因组学中基因挖掘的三板斧之一，最大优点是高效、经济、简便。通过选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样，然后比较不同极端混样池之间的多态性并结合表型进行目...
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代谢组学实验、质控与分析
1.实验及质控 （1）项目流程 代谢组学分析的特点： 流程长； 样品量大，项目周期长； 个体差异大； 设备不稳定性； 样品复杂，基质效应显著。所以，质量控制是代谢组学研究基础...
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富集分析柱状图大集合：通路展示在柱子上
富集通路常用的展示方式就是柱状图，之前我们已经做过很多种了，这里我们展示一种，将通路名称加在柱子上，这样展示的一个好处就是节约地方。 往期精彩： 复现Cell图表：双侧柱状图...
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生信分析19：PlantscRNAdb-植物单细胞转录组数据库的使用PlantscRNAdb 2021 Molecular Plant PlantscRNAdb: A database for plant single-cell RNA an...
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转录组分析要提前了解的若干问题
1、什么是转录组测序？ 转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研究对象...
