您好，请问这个问题您后来解决了吗？如何解决的呀？
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
IP属地：黑龙江
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你好，请问定义模型文件中的历史文件设置，一般依据是什么呀？
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
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fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
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你好，想请教一下定义历史事件的时候，一般依据是什么呀？
Fastsimcoal2 模拟群体案例
假设我们想模拟经历了以下群体演化历史的群体样本： 我们在3popDNASFS.par文件中来描述这个群体演化历史的过程，这个演化过程是时间回溯的，从下往上依次来描述这个过程：...
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我也想了解这个问题，请问您设置的依据是什么呀？
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
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您好，请问map计算遗传距离时，需要知道总遗传距离吗？怎么算这个遗传距离呢？
群体适应性分析——选择信号
●选择信号：生物在自然选择或人工选择过程中，由于选择作用在基因组上留下的遗传多态性降低、连锁不平衡等选择印记。●选择性清除（selective sweep）：受选择基因座位的...
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请问物种总的遗传距离怎么得到呀？遗传距离一般不是不同物种之前吗？
2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析
转载自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw 背景 选择清除分析是常用于鉴定群体基因组水平受选择区域的一种方法，其...
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你好我有个问题想请教就是，我用的基因组序列已经经过重复序列软屏蔽，那么还需要加上repeat的lib和gff文件吗？
基因注释：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本为3.01.04 第一轮：将已知基因比对到基因组 包括两个部分：🔸屏蔽重复序列🔸将已知的转录组/蛋白序列与基因组进行比对 1.（可选）构建自定义重复序列...
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老师您好，请问在可以得到转录本三种策略中，最推荐的是使用使用STAR + StringTie + gffread 获取转录本这个对吗？感觉文中似乎有点表达模糊，谢谢老师☺
使用MAKER进行注释: 训练SNAP基因模型
准备阶段 训练SNAP模型，需要准备三个文件，分别是参考基因组序列，组装的转录本序列和同源蛋白序列。 对于参考基因组序列，我们要保证N50需要超过预期基因长度的中位数，否则注...
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使用MAKER进行注释: 训练SNAP基因模型准备阶段 训练SNAP模型，需要准备三个文件，分别是参考基因组序列，组装的转录本序列和同源蛋白序列。 对于参考基因组序列，我们要保证N50需要超过预期基因长度的中位数，否则注...
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你好请问这个路径里的config文件夹/01.bin/Augustus/augustus_config是从原config文件夹复制过来的吗
2023-05-23 augustus训练
正在更新。英文是真的看不习惯。参考：使用MAKER进行基因注释(高级篇之AUGUSTUS模型训练） - 简书 (jianshu.com)[https://www.jiansh...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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比对建树那些
QuIBL学习
QuIBL(Quantifying Introgression via Branch Lengths) 可以检测树不一致的情况是ILS 还是渐渗导致的，下面是网站。 步骤的操...
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请问中间那下脚本来自哪里呀？
QuIBL学习
QuIBL(Quantifying Introgression via Branch Lengths) 可以检测树不一致的情况是ILS 还是渐渗导致的，下面是网站。 步骤的操...
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芜湖，我又回来了，和坐过山车一样
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主要分享一些自己的学习过程，以菜鸟干货为主，大家有问题可以在我的博客交流(打赏也是)<br><br>
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小江同学
