标题:利用短读长测序数据的聚合变异检测方法,实现对旁系同源基因的群体遗传学和疾病研究 作者:Timofey Prodanov, Sang Yoon Byun, Vikas B...
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《The gene-like promoter and transcription of LTR retrotransposons》,研究对象是玉米中的长末端重复反转录转座子...
HPRC2概览 这篇文章介绍的是 HPRC2(Human Pangenome Reference Consortium Release 2),即人类泛基因组参考计划的第二阶段...
第一次杂交是: 热带种甘蔗 Badila(拔地拉)♀ × 滇蔗茅 ♂ 所以F₁里的染色体来源为: 40条热带种染色体:来自母本 Badila15条滇蔗茅染色体:来自父本滇蔗茅...
TOGA2 可以理解为一套面向比较基因组学的自动化基因注释与同源基因识别软件。 它主要解决两个问题: 新组装的基因组里,哪些区域是基因?这些基因与参考物种中的哪个基因互为同源...
panNonB 项目笔记整理——基于泛基因组的非经典 DNA 结构鉴定、分布、保守性和功能注释流程一、项目概述(Overview)项目名称 panNonB pan = pan...
一、故事的起点:基因组复制后,两个亚基因组命运不同 植物进化中经常发生全基因组复制。复制发生以后,每个基因可能出现两个甚至多个拷贝。 理论上,这些拷贝最初功能接近,似乎应该被...
序号HEXRGB1#4682BErgb(70, 130, 190)2#E25822rgb(226, 88, 34)3#F3B734rgb(243, 183, 52)4#4EA...
西葫芦中SNP和SV的不同选择约束为了刻画塑造西葫芦基因组变异的进化力量,我们研究了SNP和SV对野生种群以及两个栽培亚种(ovifera 和 pepo)适应性变异的贡献。我...
3. 格式转换功能 Convert AGAT 可以在多种注释格式之间转换。 脚本功能agat_convert_bed2gff.plBED 转 GFF3agat_convert...
作者先开发了 panCG 流程 以前的泛基因组研究主要看蛋白编码基因,也就是“哪些基因有、哪些基因没有、哪些基因扩增了”。但很多性状不是由基因本身改变造成的,而是由调控元件改...
根据HiC信号鉴定同源区块A 同源组区块
Haplotype-resolved genome of autotetraploid alfalfa (Medicago sativa) Regen-SY27x uncovers large scale structural variation and resistance gene dynamics
DOI https://doi.org/10.64898/2026.05.01.722254
使用 k-mer 图评估单倍型分区使用 k-mer 图评估单倍型分区 k-mer 比较图是一类重要的基因组组装评估工具,它们通过比较测序 reads 中的 k-mer 内容与组装结果中的 k-mer 内容来判...
使用 k-mer 图评估单倍型分区 k-mer 比较图是一类重要的基因组组装评估工具,它们通过比较测序 reads 中的 k-mer 内容与组装结果中的 k-mer 内容来判...