群体进化与选择信号：●生活在世界不同区域的生物群体在历史长河中经历千万年的自然选择、人工驯化、迁徙、遗传漂变等事件的洗礼，有的物种灭绝，有的物种分化出不同的亚种或亚群,甚至逐...
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群体遗传 || 选择压力分析_基础知识个人博客原文地址 基本原理 [站外图片上传中...(image-38780a-1577372733833)]原始群体中，遗传多样性是十分高的，整个序列的核酸diversity...
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重测序分析（13）群体进化分析之群体选择分析
进化论 - 达尔文进化论 生物物种存在广泛变异 自然选择，适者生存和繁殖，不适者淘汰 生命是单起源的 - 中性学说 大多数突变是“中性”的 进化主要是中性突变进行随机的遗传漂...
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Fst、PI、TajimaD值的计算Fst值的计算 群体间分化指数fst,取值范围0~1，值越大表明群体间分化程度越高，亲缘关系越远。 这个窗口大小和步长不影响结果 曼哈顿图 首先上传数据，每列数据类型都为数值...
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【群体遗传】选择信号分析-Fst、Pi1.选择信号分析—Fst选择信号分析 概念 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群...
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群体遗传学统计指标——群体间分歧度检验（Fst）基本概念 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。用于衡量种群分化程度，取值从0到1，为0则认为两...
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【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了，网红教授宣传得很成功，功能也比较强大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。简单总结下用法，以后用时可直接找...
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无参物种背景基因GO注释
相似的基因在不同物种中，其功能往往是保守的。通过GO注释可获得跨物种的同源基因及其基因产物的功能描述。对于非模式生物或者无参考基因组的项目，经常需要进行背景基因的GO注释，以...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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Hi-C技术的初步了解最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图，所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全称是什么？ A: 高通量染色体构象...
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【哈佛大学：计算生物学 & 生物信息学】学习记录（五）为什么没有（四）？（四）主要说的就是SAM格式，网上一搜就有，就没必要了（五）就草草地记录了Chapter 4.1: RNA-Seq Applications - Chapt...
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RNA-seq名词解释（8）（十）、分析流程及软件列表 有参转录组：针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。 无参转录组：针对尚无参考基因组序列发布的物种进行 mRNA 的分析。 DGE：数字...
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基因注释与功能的分类（3）基因集功能富集分析 一组基因直接注释的结果是得到大量的功能结点。这些功能具有概念上的交叠现象，导致分析结果冗余，不利于进一步的精细分析，所以研究人员希望对得到的功能结点加以过...
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RNA-seq 分析常用的软件如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列，且和该基因组序列比对效率较高，那么可以采用有参转录组的分析策略，直接进行分析。反之，则需要按照无参转录组的分析策略进行转录本组装...
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CRISPR-Cas9 原理注：转自一位师兄的个人网站（王进的个人网站），我觉得写的挺好挺清楚的，所以直接引用了。（如有侵权，请联系撤回） CRISPR/Cas技术是什么？ CRISPR/Cas系统是一...
