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PAML正选择文献阅读与计算方法-自用版 -
群体遗传 || Pophelper-群体结构可视化学习
Pophelper基本说明 群体遗传下游分析中的一项常规分析即是群体结构的分层展示(STRUCTURE ANALYSIS)，不同于系统树和PCA，群体结构分层可以分断出小群体...
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跟着Science学保守元件(Conserved Elemtns)的鉴定0.代码来源文章参考:《Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evoluti...
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二代测序通过bam文件统计深度和覆盖度2024年3月1日更新 推荐直接用最近的新软件PanDepth[https://github.com/HuiyangYu/PanDepth]，C语言写的，速度很快。 以下为旧...
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Fastsimcoal2 模拟群体案例假设我们想模拟经历了以下群体演化历史的群体样本： 我们在3popDNASFS.par文件中来描述这个群体演化历史的过程，这个演化过程是时间回溯的，从下往上依次来描述这个过程：...
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仅作个人笔记 - 早期基因流的fastsimcoal2模型的配置文件仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂 只谈两个群体 配置文件来自于fsc论坛https://groups.google.com/g/fastsimcoal/c/AKrF...
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fastsimcoal基因流和种群历史动态可视化解读参考 大型基因组SLAF-seq蕨类植物孢子强扩散能力下生态适应塑造的遗传分化格局Ecological adaptation shaped the genetic struc...
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使用Agora/ANGEs构建祖先核型0.忘了是在那篇文献看到的，用了Agora，再把Agora的输出结果喂给ANGEsAgora和ANGEs都是构建祖先核型的软件个人实测是Agora构建的结果太碎了, ANGE...
