peacezhang

Hifiasm 使用教程 介绍 Hifiasm 是一个快速的单倍型解析 de novo 组装软件，最初设计用于 PacBio HiFi 读取。其最新版本可以通过利用超长的 O...

生信石头

基因组组装这块我看的不是很多，尽管也看过一些资料，跟朋友也讨论过。但仍然感觉理解不够深入。索性，自己直接肉眼看看，或许更为实在。 hifiasm 输出结果有哪些？ 一般来说，...

Yizhe_Lin

“简化基因组”这个词最早来源于简化基因组测序（reduced representation genome sequencing），而简化基因组测序是一个笼统的概念，属于一类测...

生信卷王

写在前面 以下内容均来自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班课堂笔记 1. Genome de nove 基础知...

ytbao

转座子鉴定方法 转座子的鉴定方法基本归于两大类：从头预测、基于同源比对。 从头预测算法 de novo 包括：基于基因组序列比对的方法、K-mer 方法、基于结构特征的方法基...

花生学生信

数据准备GeneCount文件包含了所有同源基因组数目不为1的所有基因组，在各个样本中的数目；UnassignedGenes文件则包含了仅包含一个基因的同源基因组的样本来源信...

ytbao

基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可预测）散在重复（Dispersed repeats），...