一、测序数据的准备 新建工作目录，GATK-analysis 新建data文件夹；mkdir data 1.1 公司返回的测序下机数据 例如：6个NGS测序样本；Raw da...
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QTL定位方法及花期文章阅读记录11摘要部分 起初，大刍草进化而来的玉米是短日照，在短日条件下开花，长日照条件下花期推迟甚至不开花。通过定位克隆和关联定位，将一个花期数量性状位点确定位于CCT转录因子(ZmC...
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玉米花粉发育相关过程
参考学习自公众号：细胞全能型与再生 玉米雄穗每个分支上有多个小花，每朵小花又包含一朵较大的上位花和一朵较小的下位花。通常上位花比下位花在发育进程上早一天。每朵上/下位花分别含...
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绘制 SNP 密度图一般使用 CMplot 绘制SNP密度图：包链接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图，仅仅需要三列即可：a. 第...
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GWAS全基因组关联分析全流程
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清单，也许以后有新的方法或者...
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PGDspider的使用1、该软件的使用需要在java环境内，下载java并安装 https://download.oracle.com/java/18/latest/jdk-18_windows-...
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