IRanges用于解决序列在基因组上的位置问题，GRanges在IRanges的基础上增加了染色体和DNA链的信息。在GRanges内部可以使用IRanges构建序列位置信息...
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受益匪浅呀
老板亲自传授的文献阅读方法
前言 论一个气场合适的导师的重要性。想起一个微信朋友前截图 A：导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，跟你牛不牛没有关系 B：你错啦，导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，很大程度上决定我牛不牛...
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老板亲自传授的文献阅读方法前言 论一个气场合适的导师的重要性。想起一个微信朋友前截图 A：导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，跟你牛不牛没有关系 B：你错啦，导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，很大程度上决定我牛不牛...
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学习方案：如何才能入门生信？按我前面文章继续反思：如何才能入门生信？中提到的学习方案执行。 总的方案： 孟老师推荐关于最后一部分的四大切入点，最后是把几个不同的Seq的过程细节都了解一下。 第一部分：l...
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RepeatMasker
What RepeatMasker是一款基于Library-based，通过相似性比对来识别重复序列，可以屏蔽序列中转座子重复序列和低复杂度序列（默认将其替换成N），几乎用于...
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生物技能树--fasta和fastq格式文件的shell小练习这个是有机结合生物信息学的linux和数据格式的练习题：下载bowtie2软件后拿到示例数据： http://ascii.911cha.com/ 做题之前的碎碎念：本来用co...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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生信技能树--Jimmy - Linux 20题一、在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列。 二、在创建好的文件夹下面，比如我的是 /Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/...
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第二部分 第7章基本统计分析
7.1 描述性统计分析 连续型变量的中心趋势、变化性和分布形状的方法。 7.1.1 方法云集 基础安装中的函数：summary()函数来获取描述性统计量（最小值、最大值、四分...
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第二部分 第6章 基本图形
6.1 条形图 简单条形图 barplot() 堆砌条形图和分组条形图 均值条形图 条形图的微调 par()函数 棘状图 spine()函数 6.2 饼图 pie(x, la...
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第五部分第19章使用ggplot2进行高级绘图"学习做图还是以实践为主，因此写好脚本的代码结合笔记梳理思路。这里笔记比较简略。" 19.1 R中四种图形系统 图形系统的载入 系统基础安装中是否包含是否需要显示加载base...
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第一部分第5章 高级数据管理5.1 一个数据处理难题 5.2 数值和字符处理函数 5.2.1 数学函数 数学函数 函数描述abs(x)绝对值abs(-4)返回值为4sqrt(x)平方根sqrt(25)返...
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第一部分第4章 基本数据管理4.1 一个示例 4.2 创建新变量 变量名 <- 表达式 运算符描述+加-减*乘/除^ or **求幂x%%y求余x%/%y整数除法 transform函数：创建新变量并将...
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第一部分第3章 图形初阶
3.1 使用图形 载入数据plot()函数abline()函数加title(" ") 3.2 一个简单的例子 plot()是R中为对象作图的一个泛型函数help(plot)可...
